隐适美公司的ClinCheck软件在进行模拟计算时，缺少齿槽骨厚度、上下颚骨和头盖骨的位置关係、牙根形状和位置等这些重要资讯。我们必须从牙科用CT（立体的颚骨与牙根）或侧颅X光（侧脸；鼻子嘴唇下巴与头部的相对位置）等X光中获取这些缺少的资讯，并将其考虑进去，设计出具有高预测性、高实现性的模拟方案。使用侧颅X光可以将门牙的位置角度数值化，预测治疗后的前牙位置和侧脸变化量。此外，忽略CT的模拟方案可能会将牙根移动到齿槽骨外部，引起严重的牙根吸收。本院会利用这些X光辅助，设计出高美学性、高安全且具有高再现性的治疗方案。（从2023年8月开始，仅限Comprehensive Package，可以将牙科用CT的资讯整合到ClinCheck软件中。）

矫正治疗的本质是进行空间（牙齿之间的间隙）的交换。大多数的病例是空间不足，需要创造空间。大致上可以分为移动牙齿以腾出空间的方法（例如扩大牙弓或后牙的远心移动）和磨牙齿使其变小的方法两种。后者就是所谓的「IPR，Interproximal reduction」，只需磨削邻接的牙面，对于医师来说远比前者更为简便。 这种方法看起来会对牙齿造成损伤，但实际上少部分的磨削（一个邻接面约0.25毫米）是教科书上也有的正统方法。然而，由于隐形矫正的牙齿移动效率比传统矫正低，所以有些医师会将就选择，完全采用简便的IPR，而不使用移动其他牙齒腾出空间的方法。如此会导致磨牙的量过大，会造成牙齿明显变形或牙齿敏感等副作用。如前所述，本院的坚持是要实现与传统矫正完全相同的效果，因此选择首先移动牙齿并创造足够的空间，最后非不得已才做再IPR，尽量减少磨牙齿的量。

市面上宣传的隐形矫正的优点之一是回诊次数较少。更甚者，也有一些系统声称﹔只要最初取得一次牙模之后就完全无需再回诊。这是因为隐形矫正的机制是在一开始制作一套的透明牙套，模拟齿列从“不整齐状态”排到“整齐的最终位置”，所以只要将一整套牙套全部交给病人并嘱咐病人按时间交换，理论上就不需要回诊。然而，最初的模拟几乎百分之百会在中途与实际牙齿的移动产生偏差（预估的隐形牙套和实际的齿列不合）。 这样一来会导致移动不如预期，治疗时间拖长， 更糟糕的是不合适的隐形牙套会对牙齿施加不当的力量，引起牙根吸收或牙髓坏死等问题。这种偏差对病人本人来说很难察觉，即使察觉到也无法采取补救措施。因此，定期回诊还是相当重要的，回诊时医师会非常注意确认是否有偏差，并对偏差采取进行修正。基本上，对于小的偏差会使用辅助装置来修改，对于大的偏差则需要再次采取牙模并制作追加的透明牙套组。本院建议最好能像传统矫正一样，每个月来回诊一次。每次回诊时，我们会仔细确认现实齿列与模拟之间的差距，一旦出现偏差，立即采取对策，使治疗时间缩到最短。此外，如果约诊时间足够，也会尽量做牙齿的清洁和检查蛀牙。当然，利用隐形矫正的特性减少回诊次数也并不是错误的，如果病人有需要确实可以拉长回诊的间隔。

在隐形矫正治疗中，会将称为附件的树脂黏附在牙齿表面，以维持牙套和牙齿的贴合度，并增加移动牙齿的效率。我们会根据不同的移动目的设计不同的附件形状。最后黏附在牙齿上时也会特别注意其形状是否相符，以达到最大的治疗效率。

牙套矫正治疗进行中，有时会需要请病人自行挂上颚间橡皮筋。如前所述，这是牙齿移动上相当重要的辅助装置。希望患者能遵照医嘱确实配戴，我们的也会提供细心的指导，希望能确实的移动牙齿。

牙齿移动时，需要固定源（支撑）。当两边牙齿互相拉扯时，互为固定源，自然两者都会移动。然而，某些状况下，我们会希望有一边的牙齿是不要移动的，如果动的话会造成最终成果不完美（比方说前牙退的不够多时，暴牙改善会不完美）。这时就需要使用在牙槽骨中植入迷你骨钉，骨钉是绝对不会动的固定源。这是一种在传统矫正时也经常使用的手法。在传统矫正中，通常可以使用咬合力来提供一部分的固定源；然而隐形矫正中由于隐形牙套复盖了一层在咬合面上，上下牙齿不会接触，所以咬合力无法利用，所以使用骨钉的机会更多。本院会在适当时机使用骨钉，以实现最完美的治疗成果。